1940年3月，汪伪组建由前国民党军官毕忠良担任处长的“特别行动处”为虎作伥，一直潜伏在他身边、代号“麻雀”的中共党员陈深，与组织暂时失去联系。置身险境中，陈深信仰坚定，冒死营救上线及抗日志士，却遭遇重重陷阱，危机不断。智计过人的陈深能否最终在日本、汪伪政府等各派势力之间的微妙缝隙中生存，最终挫败了日本侵略者的阴谋？
1941年冬，上海。中共特派员沈秋霞（代号“宰相”）在执行任务时与安六三接触，但安六三随后被捕并透露了沈的行踪。沈在逃离时被特工击中，被捕。同时，陈深（共产党的地下工作者，伪装成花花公子和特工队长）在舞厅发现了沈并试图帮助她。沈被送到医院，陈深暗中制造混乱以营救她，但被毕忠良（特工处长）的部下监视。尽管面临怀疑和危险，陈深仍设法在医院制造爆炸以转移注意力，试图救出沈秋霞。
在医院爆炸的掩护下，陈深成功制造混乱并设法摆脱了监视他的伍志国，同时让毕忠良误以为是伍志国试图劫走沈秋霞。陈深深知毕忠良不会轻易相信他，因此他只能依靠组织的营救计划。尽管沈秋霞坚称自己是“宰相”并拒绝透露更多信息，但毕忠良对陈深的怀疑并未消除。在毕忠良的生日宴上，陈深受邀出席，席间毕忠良感激陈深当年的救命之恩，但饭后却要求陈深一同审问沈秋霞。同时，陈深发现毕忠良的手下一直在跟踪他，他意识到危机四伏。为了转移毕忠良的注意力，陈深邀请刘兰芝参观孤儿院，而这一切都被毕忠良的部下看在眼里。在审讯室，陈深不忍看到沈秋霞受烙刑，决定亲自审讯。毕忠良再次逼迫陈深开枪杀人，但陈深因早年杀人经历而不敢开枪。毕忠良对陈深的怀疑达到顶峰，质问他关于“米高梅”事件和医院爆炸案等事宜，让陈深陷入了困境。
在面对毕忠良的质疑和拷打时，陈深继续伪装自己。他发脾气、摔门而去，但最终还是被兄弟之情唤醒。唐山海和徐碧城是军统卧底，他们以夫妻之名潜伏在上海特工行动处。陈深与徐碧城曾经在一起过甜蜜时光，但现在却只能淡淡伤感。李小男向徐碧城大方介绍自己是陈深的女朋友，让徐碧城怅然若失。
审讯室中，毕忠良为逼问“麻雀”下落，对沈秋霞施加强硬手段。沈秋霞宁死不屈，咬伤毕忠良耳朵。毕忠良为试探唐山海与徐碧城，决定由二人押解“宰相”至南京，为陈深营救沈秋霞提供机会。陈深制定营救计划，准备在无锡行动，并准备三张赴香港船票，欲送沈秋霞与侄子皮皮离境。同时，陈深答应李小男带她出去玩，实则为请假方便营救行动。唐山海与徐碧城小心维持婚姻假象，徐碧城内心思念陈深。陈深意识到此次押解是毕忠良的试探，但已无法改变计划。临行前，形势突变，唐山海被撤回，由陈深与徐碧城押解“宰相”前往南京。
陈深和徐碧城临时受命押解“宰相”去南京，但陈深怀疑这是毕忠良或李默群的试探。唐山海洞悉毕忠良的心思，向李默群求助，只留下了徐碧城。毕忠良的手下试图偷陈深的公文包，但被李小男中断。徐碧城心中澎湃，回忆和爱情在心中搁置。在列车上，沈秋霞劝陈深放弃营救，但陈深决心救出大嫂。在无锡站，营救行动开始，但陈深改变计划，改为公路押送“宰相”，暂停了营救沈秋霞的行动。
陈深与徐碧城在南京押解途中受毕忠良监视。陈深设法摆脱跟踪，终在公路上成功营救沈秋霞。但沈秋霞为保护陈深身份而牺牲。徐碧城自愿当人质，显深厚情谊。任务结束后，陈深虽摆脱毕忠良疑心，但失去亲人让他痛苦。毕忠良怀疑唐山海与徐碧城关系，并处决了无用的线人安六三。
唐山海察觉到徐碧城对陈深的特殊情感，提醒她保持距离。毕太太刘兰芝安排陈深和徐碧城一同运送物资到猛将堂孤儿院。在孤儿院，陈深深感自责，不知道如何告诉皮皮其母沈秋霞已牺牲。徐碧城听到同事对陈深的评价，觉得他仍如过去般善良。唐山海暗中向军统提供汪伪特务名单，陈深的名字在列。徐碧城对此毫不知情。陈深送刘兰芝回家途中遭军统暗杀，怀疑行动处有军统卧底，唐山海成为疑点。暗杀失败让唐山海懊悔，他开始审视自己的动机。徐碧城怀疑唐山海，但询问无果。陈深在毕忠良面前试探唐山海，怀疑加深。柳美娜向唐山海示爱，同时毕忠良遭到军统暗杀受伤，毕忠良和行动处陷入紧张。
陈深为庆祝李小男电影杀青，邀请她到红灯笼湘菜馆吃饭，却意外遇见唐山海给徐碧城送花。徐碧城首次收到花，感到幸福。晚餐时，陶大春准备暗杀陈深，但徐碧城和唐山海的出现打乱了计划。徐碧城质问唐山海隐瞒行动的原因，唐山海交出特务名单并告知刺杀计划。徐碧城坚持相信陈深并策反他，要求从名单中移除陈深。陈深怀疑自己被刺杀，请求毕忠良安排秘密任务。他偷到柳美娜的钥匙，试图获取日军的罪恶计划。陈深从毕忠良的话中猜测有重大秘密计划，但自己级别不够。他注意到吴龙的烟土生意和军统的刘三金、刘三木兄弟，开始部署。唐山海和徐碧城发送特务名单前，徐碧城欲上报私自行动，被唐山海阻止。陈深尾随他们，告知第二天的交易情况给唐山海。唐山海要求陶大春干掉刘三木。毕忠良离开上海执行秘密任务。
刘三木在交易中被杀，吴龙逃脱。陈深和军统都想找到吴龙。陈深暗中观察唐山海，对他的身份产生怀疑。晚上，唐山海夫妇收到组织回电，准予将陈深列入暗杀名单，这让徐碧城十分痛苦。她决定保护陈深，实施自己的计划。同时，吴龙联系毕忠良，约定在青峰茶馆见面。陈深得知此事后，前往茶馆等待吴龙，但吴龙警觉后逃跑。陈深意识到事情已无法收拾，自己的身份可能会暴露。他考虑以暴露唐山海为代价保护自己。
徐碧城为让陈深不参加李默群的寿宴，编造了李小男被绑架的谎言。陈深识破后，仍决定参加寿宴，并顺藤摸瓜找到李小男的下落。在寿宴上，陈深告诉徐碧城吴龙的下落，并暗示徐碧城自己已知晓她的计划。徐碧城试图说服唐山海放过陈深，但唐山海坚持要除掉他。陈深推测出整个事件，并意识到危险即将来临。寿宴结束时，吴龙趁机冲向毕忠良，但被陈深等人制止。
在烟火表演中，有人试图暗杀李默群，毕忠良及时反应并开枪反击，唐山海顺势将吴龙推出去作为替死鬼，保护了自己的身份。陈深对唐山海的城府感到不安，但也赞赏他的聪明。吴龙的死让陈深、徐碧城和唐山海形成了统一战线，徐碧城为此感到高兴。毕忠良怀疑起唐山海的身份，但陈深用“美男计”的策略暂时缓解了局势。陈深决定接近徐碧城以获取更多信息。同时，陈深关心皮皮，将他视为自己的孩子。在办公室，陈深和徐碧城的谈话充满暖流。毕忠良撤去了对唐山海的跟踪，局势暂时平稳。陈深邀请李小男下棋，并询问她关于自己公文包的事情，但李小男表现得调皮且含糊其辞。
李小男因与人发生矛盾而跑到陈深家寻求庇护，却意外卷入了一场由陶大春策划的暗杀行动。陈深机智地化解了炸弹危机，但房屋被炸毁。唐山海及时将陈深送往医院，引起了毕忠良和徐碧城的注意。徐碧城对陈深的关心让唐山海感到嫉妒和愤怒。唐山海与徐碧城的关系因此变得紧张。毕忠良查出爆炸是由伪雷引起的，并误以为陈深和李小男同居。唐山海提前安排陶大春替换书店老板，成功阻止了毕忠良的调查。
毕忠良和刘兰芝误以为陈深和李小男是一对，开始为他们的婚事做准备。陈深向毕忠良解释自己只是把李小男当兄弟，并没有结婚的打算。陈深出院后，在片场为李小男出头，让她感受到了被保护的安全感。徐碧城与唐山海关系紧张，两人约法三章，保持距离。李小男搬到行动处住，就在唐山海夫妇隔壁，她的到来让徐碧城感到不舒服。陈深和唐山海怀疑中共卧底“麻雀”可能就在他们中间，而陈深的身份也让他们产生了怀疑。李默群安排徐碧城到机要处做秘书，让她能够接触到更多机密信息。徐碧城在归档文档时发现了自己的同学周丽出现在罪犯转移通知单上，她想要救出周丽，但陈深和唐山海都反对这个冒险的计划。在送孙太太回家的路上，陈深意外发现了一个秘密，这个秘密可能会对整个局势产生重大影响。
陈深发现孙太太与江医生有私情，并利用这个信息安排徐碧城以行动处医生的身份进入漕河泾监狱，让她与周丽见面。尽管陈深知道这样做可能会暴露自己的身份，但他还是选择满足徐碧城的心愿。徐碧城在见到周丽后心情沉重，陈深安慰她并陪伴在她身边。徐碧城决定瞒着唐山海营救周丽，她找到陶大春帮忙，并叮嘱他注意安全。然而，唐山海发现了徐碧城的计划，而陈深也被临时安排去押送犯人转狱，这让局势变得更加复杂和危险。
徐碧城找陈深帮忙拖延押送犯人的时间，以便她的劫囚计划能够成功。陈深猜出了徐碧城的计划，并在路上尽量拖延时间，同时对囚车做了手脚。然而，毕忠良已经预料到了徐碧城的计划，并包围了乔家栅。徐碧城向唐山海求助，唐山海则去乔家栅通知陶大春取消计划。陈深在途中对囚车做了手脚，导致汽车发动不了，但最终还是被修好了。唐山海杀死行动处队员，进入乔家栅通知陶大春取消任务，但吕明却没有撤回，他救妻心切，最终被行动处队员发现。毕忠良对队员被杀感到愤怒，而刘二宝在现场发现了唐山海掉落的纽扣，事情即将真相大白。
吕明因为思念妻子而返回事发地，被行动处队员抓获。毕忠良用纽扣和玉佩作为诱饵，让吕明在两者之间做出选择，以此来逼迫他招供。同时，毕忠良封锁了消息，并在紧急会议上暗中观察唐山海，以找出丢失纽扣的人。陈深帮助唐山海和徐碧城应对毕忠良的调查，三人串好口供，暂时化解了危机。然而，毕忠良仍然怀疑徐碧城和刘美娜，并逼迫唐山海暴露自己。陈深感到焦虑，他不仅要担心徐碧城的安全，还要想办法找出被抓的飓风队员是谁。同时，他还要掩饰自己与唐山海的私下交往，以免被毕忠良发现。整个局势紧张而复杂，各个人物之间的关系也变得更加错综复杂。
楼下的线人实际上是监视唐山海的，而非陈深。陈深利用这个机会，与唐山海换装后，成功躲避了毕忠良的追踪。同时，他也借此机会向李小男传达了与唐山海的联系。然而，这个行动却引起了毕忠良的怀疑，他将漕河泾监狱的于胖子也列为了重点怀疑对象。刘胖子被绑在行动处的大牢中，等待着审问。徐碧城和刘美娜被软禁在行动队中，度过了一个难熬的晚上。为了防止自己的身份暴露，徐碧城主动找到毕忠良，假意向他哭诉怀疑唐山海在“乔家栅”金屋藏娇，以证明三人白天的单独谈话都没有撒谎。这一举动成功地搅乱了毕忠良的思绪，让他对唐山海产生了怀疑。陈深奉命跟着毕忠良审问吕明。在毕忠良的糖衣炮弹下，一心想要和妻子团聚的吕明彻底崩溃，他交代出自己曾见陶大春与他的上级见面。毕忠良召集了处里所有的女人，让吕明指证。此时，李默群打来电话质问自己的外甥女被毕忠良软禁的事情。毕忠良答应，只要没有证据，一定放碧城回家。然而，他内心却希望徐碧城的身份能在今天就被揭露。在关键时刻，吕明并没有指认徐碧城，让毕忠良大感意外。其实吕明已经认出了徐碧城，但他之所以没有指认，是因为陈深将吕明妻儿的照片拿给他看，希望他牺牲自己保全碧城和他的妻儿。然而，在被押解回牢房的途中，吕明试图抢下行动处队员的枪了结性命。在两人的搏斗中，陈深开枪杀死了吕明。这一举动既是为了保护徐碧城和陶大春的安全也是为了让吕明得以解脱。
陈深面对吕明的生死抉择时内心挣扎，最终行动处队员开枪打死吕明，毕忠良愤怒失望。徐碧城获释后深感自责，决定不再做唐山海的搭档。唐山海和陈深安慰并鼓励她。陈深带徐碧城去孤儿院学哑语，加深彼此理解。徐碧城被软禁令毕忠良得罪李默群，要求彻查劫囚事件。陈深与唐山海结盟应对，提议找替死鬼解决。两人都深爱徐碧城，陈深更了解她，希望她追求自己的生活。唐山海向徐碧城道歉，鼓励她追求生活。徐碧城搬花草回家，请邻居李小男喝茶，两人相谈甚欢。
于胖子成为了替死鬼，因赌运不佳输红眼后被陶大春借钱逼至绝境。陶大春故意设计让他走投无路，最终于胖子误以为行动处队员是债主，打晕他们后逃跑。唐山海主动请命追捕于胖子，毕忠良怀疑其借机杀人灭口，派刘二宝同行监视。陈深发现唐山海已派人追杀于胖子，希望他们先解决掉于胖子。于胖子最终被发现吊死在旅馆房梁上，留下一封自称卧底、周丽为妻的信。毕忠良结案，内鬼事件告终。徐碧城责问唐山海杀无辜于胖子，唐山海希望她过自己的生活。陈深对唐山海垃圾桶中的纸团好奇，想借机窥探，被唐山海婉拒。陈深、李小男到唐山海家做客，徐碧城被李小男的银杏叶项链触动。陈深告诉唐山海，女孩喜欢一个男孩时，眼神会放光。
李小男透露与陈深订婚消息，徐碧城心情复杂。两人虽相互喜欢，但徐碧城对陈深旧情难忘。徐碧城偶遇陈深，感动于他仍记得自己的饮食喜好。她询问陈深是否为共党，得到默认。徐碧城提及日军绝密计划，显示军统也对此感兴趣，陈深和唐山海将面临对决。唐山海送徐碧城银杏叶项链，但她不领情，令唐山海痛苦。徐碧城在柳美娜办公室掩护陈深进入档案室寻找文件，但未果。唐山海发现陶大春被跟踪，与陶大春约定换地方接头。毕忠良太太邀请陈深和李小男参加李默群攒的局，实则设伏。贵客苏三省出现，原是跟踪陶大春并助其找新接头地点的人，现投奔国军。
苏三省的出现让众人感到不安，他的到来似乎预示着即将到来的风暴。在雨中，他的形象冷峻而充满杀气，让人不寒而栗。苏三省向李默群献上军统上海区各分站的秘密据点地址和主要人物代号，这份大礼让李默群等人欣喜，却也让唐山海和徐碧城感到万分焦急，因为他们知道这意味着陶大春等人已经暴露。徐碧城决定通知女服务员传递情报，然而她的行为被陈深察觉。陈深意识到苏三省的投诚可能给军统带来灭顶之灾，他紧张地阻止徐碧城。女服务员得到情报后试图离开，却被行动处队员逮住。在拷问下，女服务员选择一跃而下，以死保守秘密。毕忠良下令陈深和唐山海受苏三省指挥，联合捣毁军统在上海的老窝。唐山海明白这是毕忠良的陷阱，他无法向队友传达情报，只能眼睁睁地看着战友被杀害。苏三省的手段和野心让陈深和唐山海感到震惊。在饭店打麻将的李默群、毕忠良等人看似悠闲，却各自心怀鬼胎。徐碧城的惊慌失措和故作镇定都被毕忠良看在眼里。行动处内，被抓的军统人员咒骂苏三省的叛变，而毕忠良则试图劝降曾树。唐山海和徐碧城回到家中，唐山海身心俱疲，感到愧疚和仇恨。他要求徐碧城离开上海，但徐碧城坚决要留下来陪他。陈深也感到沉重，他拒绝了李小男的示爱，不愿让她跟着他冒险。
陈深因军统危机和对李小男的爱而拒绝她。唐山海夫妇早餐时遇陈深，他答应掩护唐。陈深带他们到裁缝铺，唐找陶大春未果。毕忠良劝降曾树，得知更多军统秘密，派苏三省抓捕。唐山海被发现，匆忙返回。苏三省突袭军统据点，陶大春侥幸逃脱。陈深、唐山海受命查卧底“熟地黄”。毕忠良怀疑陈深与唐山海夫妇过近，陈深提醒唐勿轻举妄动。陶大春探听虚实，发现被围，决定暂不行动。
苏三省和徐碧城辨认军统人员无果，苏险被袭击。陶大春得唐山海、陈深相助逃脱。李默群提升苏三省为第三分队队长，制衡毕忠良。毕忠良透露想出国，苏三省凌辱曾树。唐山海与陶大春会面，要求陶返回总部。李默群安排苏三省住处，苏对姐姐流露温情。李小男向徐碧城表白对陈深情意。李默群命苏三省调查“麻雀”和“熟地黄”。唐山海怀疑陈深是“麻雀”。陈深提出让苏三省主导调查，以获日军“归零计划”。发工资日，苏三省工资被扣，向李默群告状以制毕忠良。
毕忠良向苏三省解释工资问题，暗示资金紧张可向他求助。苏三省怀疑毕忠良有私吞奖金之嫌，心生怨恨。徐碧城问陈深与李小男分手原因，陈深转移话题至任务。陈深提议联手唐山海、徐碧城除掉苏三省，二人赞同。唐山海透露“麻雀”是中共重要人物，苏三省欲查真相以置毕忠良于死地。徐碧城给苏三省金条示好，唐山海诉苦毕忠良，加深苏对毕的怨恨。苏三省得李默群特批查阅档案，陈深等人设圈套。档案室失火，苏三省被困，唐山海、徐碧城等人故意拖延救援。
苏三省被毕忠良设计陷害，档案室火灾中受伤被擒。陈深、唐山海诬陷苏三省为军统卧底，计划劫持唐山海逃跑。李默群和影佐将军介入，苏三省被带走调查。毕忠良、陈深、唐山海演戏给影佐看，计划暂时成功。陈深推测将有机会接触绝密计划，果然被毕忠良要求参与归档。苏三省回归，毕忠良和陈深担忧报复。曾树暗中帮助苏三省，毕忠良将陷害罪名安在他人头上。
苏三省怀疑徐碧城与陈深有不正当关系，决定调查两人底细。同时，他对李小男产生感情，前往剧组看望她。陈深计划获取“归零计划”，需从柳美娜处拿到档案室钥匙。唐山海利用柳美娜的感情，设计圈套获取钥匙，陈深则趁机从柳美娜的包中取得钥匙，但发现并非所需。唐山海继续演戏，假意与柳美娜和好并偷走她的钥匙。徐碧城在回家路上回忆起与唐山海的过往，而柳美娜则发现自己失去了钥匙。
苏三省目睹陈深试图用钥匙打开档案室门，但未能成功。他怀疑陈深等人有阴谋，决定派人调查唐山海和徐碧城的真实关系。同时，他怀疑徐碧城与陈深有染，但未能找到确凿证据。唐山海和徐碧城为了掩饰分居的事实，故意在行动处上演夫妻吵架的戏码，并试图通过李小男向毕忠良夫妇传递感情裂痕的消息。然而，这一切都被苏三省暗中观察，他更加确信唐山海和徐碧城是在演戏。陈深试图再次用钥匙打开档案室门，但仍未能成功，他开始怀疑钥匙的真实性。此时，苏三省的手下潜入唐山海和徐碧城的家中，试图窃取情报，但最终被唐山海发现。这一切让唐山海和徐碧城更加确信，他们的行动已经引起了苏三省的怀疑。
徐碧城和唐山海在办公室吵架，故意让柳美娜和扁头听到，以传播他们之间的三角关系。然而，这一切都在苏三省的掌控之中，他暗中观察并等待机会。陈深发现档案室钥匙是假的，与唐山海和徐碧城商量对策。唐山海决定再次接近柳美娜以获取真钥匙。在柳美娜的办公室，唐山海利用她的感情，成功拿到了真钥匙。同时，苏三省故意将一封匿名信寄给毕忠良，举报陈深与唐山海、徐碧城勾结。毕忠良找陈深谈话，试探他的忠诚。陈深机智应对，同时暗示毕忠良有人在搞离间计。毕忠良对唐山海和徐碧城的夫妻关系产生怀疑，认为他们可能是假扮夫妻。另一方面，李小男为了接近陈深，决定去照顾他在孤儿院领养的干儿子皮皮。这一切都是为了帮助陈深完成任务，同时也在慢慢拉近她与陈深之间的距离。
李小男与皮皮在孤儿院玩耍，皮皮喜欢她。她送给他一个百宝箱，希望他画出愿望能成真。陈深目睹这一切，但仍不接受李小男。毕忠良的办公室有机关，他收到密电称“麻雀”和“熟地黄”在特工处寻找“归零计划”。毕忠良知道陈深是“麻雀”，唐山海是“熟地黄”，他们与徐碧城结盟。毕忠良利用柳美娜引出特务，计划让徐碧城处理“归零计划”以揭露特务。毕忠良与苏三省合作，以解禁计划为诱饵，揭露特务身份。一切准备就绪，等待徐碧城的反应。
徐碧城拿到“归零计划”后欲分享给唐山海和陈深，但两人都不在。陈深回到行动处发现异常电线，怀疑徐碧城办公室有窃听器。他进入徐碧城办公室确认，并通过纸笔交流让她将计划归还毕忠良。徐碧城照做，毕忠良发现计划未动，怀疑徐碧城未参与阴谋或已发现窃听器。他下令撤掉窃听器，同时怀疑重庆方面有汪伪特工。毕忠良计划通过搜寻无线电揪出卧底。陈深目睹苏三省和曾树在办公室做手脚。唐山海和徐碧城因“归零计划”归属问题争执，而陈深面临新挑战。
夜幕降临，苏三省和曾树拆除徐碧城的窃听器。陈深培训同事应对电讯侦缉车，并提醒徐碧城小心。李小男接受苏三省的鲜花和点心，并答应去他家吃饭。拍戏时，苏三省救下险些受伤的李小男，自己受伤。陈深和徐碧城看望皮皮，被孩子的话触动。在行动处，陈深遇到受伤的苏三省和李小男，他夺过汤喂苏三省，并警告李小男不要和苏三省在一起。徐碧城询问陈深的态度，陈深希望李小男找个好男人。唐山海怀疑柳美娜被毕忠良收买，而毕忠良设宴监视他们。柳美娜向毕忠良请假失败，找到唐山海诉苦。陈深看穿毕忠良的目的，唐山海决定陪他演戏。李小男在饭店对苏三省亲昵，让陈深愤怒。这个周五夜晚，注定充满波澜。
在舞池中，陈深紧盯柳美娜的手包，而柳美娜期待与唐山海共舞。李小男与苏三省相谈甚欢，令陈深不悦。陈深和唐山海计划调包柳美娜的手包以取得钥匙，但行动受阻。毕忠良暗中观察，苏三省报告了两人的行踪。陈深被毕忠良叫到包厢，刘兰芝劝他珍惜与李小男的关系。在舞池中，陈深和唐山海寻找调包机会，但受到监视无法下手。唐山海紧张柳美娜发现手包被调包，但柳美娜大方展示包内物品，化解了危机。苏三省故意将酒洒在陈深身上，试图查看他的手包，但被陈深用戒指求婚的举动化解。毕忠良对陈深的解释感到失望，而苏三省坚信陈深有阴谋。陈深重新向毕忠良解释手包和戒指的来历，暂时打消了毕忠良的疑虑。苏三省仍怀疑陈深，认为他的解释是掩饰。
苏三省怀疑陈深，打电话到他办公室并暗中观察。陈深用计策让苏三省误以为他办公室里有秘密。李小男带苏三省的姐姐来行动处，苏三省从李小男处得知求婚一事。陶大春从重庆归来，与唐山海会面，表示要重建飓风队助他一臂之力。唐山海告诉他“归零计划”在行动处。李小男陪苏姐去松江喝喜酒，途中被陈深安排的人劫持，陈深和徐碧城去孤儿院看望皮皮，皮皮想画妈妈的样子让两人感到酸涩。徐碧城询问陈深帮助唐山海的原因，陈深称是为了她。柳美娜打开保险柜看到了“归零计划”，感到不安，想离开行动处。唐山海给徐碧城粽子，两人都感到难过。唐山海即将与柳美娜在宾馆过夜，心情沉重。
唐山海赴柳美娜的约，两人共度晚餐，唐山海承诺一个月后带她离开。柳美娜透露自己能接触到机要文件，唐山海引诱她说出更多。苏三省监视陈深，等待机会夺取“归零计划”，但接到姐姐和李小男被劫持的消息后离开。唐山海趁机打开档案室，却被曾树发现，锁住了档案室，困住了陈深。唐山海趁柳美娜熟睡时寻找钥匙，被柳美娜发现，但他以情话打动柳美娜，获得“归零计划”的位置。两人准备离开，唐山海通知徐碧城和陶大春准备离开上海。
陈深向柳美娜透露了唐山海的真实身份，并威胁她交出“归零计划”。柳美娜同意配合，并与陈深一同前往苏州河与唐山海会合。在途中，她向唐山海透露了陈深的计划，并交出了档案室的钥匙。陈深追赶唐山海并逼停他的车，两人发生争执。唐山海拿出假的“归零计划”交给陈深保管，并要求他掩护自己处理眼前的麻烦。徐碧城在家中担忧唐山海的安危，并巧妙地挂断了刘二宝的电话以避免暴露。毕忠良派人到唐山海家搜查，徐碧城机智应对。在苏州河，唐山海和柳美娜被行动处包围，双方交火，柳美娜不幸中枪，躺在唐山海的怀抱里。
柳美娜死在了唐山海的怀中，陶大春和唐山海跳河逃脱。陈深向毕忠良报告说柳美娜的同伙只有一个，但跳河的有两个人，暗示行动处还有其他同谋。钱秘书在唐山海家搜查时没有发现唐山海，但对他和徐碧城的关系产生怀疑。唐山海将“归零计划”交给徐碧城，但没有告诉她柳美娜的死讯。毕忠良认为唐山海是幕后操控者，但没有找到证据。陈深将一条领带藏入怀中。唐山海和徐碧城到行动处上班，装作不知情，但内心担忧。刘二宝报告说“内鬼”已经招供，愿意指认同伙，让唐山海和徐碧城更加紧张。徐碧城从钱秘书口中得知柳美娜的死讯，感到愧疚。毕忠良、陈深、刘二宝三人在行动处大牢审问“内鬼”，唐山海也跟进来看情况。毕忠良咄咄逼人，但唐山海沉着应对，暂时洗去了嫌疑。苏姐和李小男被接回行动处，李小男兴奋地讲述自己的经历，苏三省感到欣慰。
苏三省向毕忠良证明自己不是内鬼，毕忠良怀疑柳美娜的死是调虎离山之计。徐碧城质问唐山海为什么不告诉她柳美娜的死，唐山海解释这是无奈之举。徐碧城要求唐山海让李默群知道“归零计划”失窃，以观察毕忠良的反应。唐山海独自到验尸房看柳美娜，伤心落泪。陈深带李小男去医院看伤，之后送她回家，李小男更加爱慕陈深。陈深怀疑两份“归零计划”中有一份是陷阱，感到忧虑。李默群和影佐将军来到行动处，徐碧城已传达失窃消息。影佐要将毕忠良交给梅机关处理，陈深为毕忠良说情未果。毕忠良被革职，李默群负责行动处，陈深协助抓“内鬼”。陈深怀疑“归零计划”的真假是陷阱，感到困惑。
陈深拜访毕忠良的家，安慰刘兰芝并透露毕忠良的困境是圈套。毕忠良在梅机关牢房中与影佐谈话，确认计划。李默群让唐山海接任代处长，并设计让陈深救不了毕忠良。刘二宝告诉苏三省拦截交通员交换密码本的任务。陈深将领带交给唐山海，唐山海感激并答应让他看“归零计划”。在柳美娜的坟前，唐山海悲痛不已。徐碧城安慰他，两人都明白特工的悲哀。唐山海与陶大春见面，拿到新密码本，并更改了“归零档案”的时间地点。徐碧城与陈深在教堂交换情报，发现情报是新造的，她终于明白陈深和唐山海都在互相利用。徐碧城将未更改的“归零计划”交给陈深，希望为赶走日本人做出贡献。苏三省按毕忠良的安排抓获交通员，拿到密码本，毕忠良建议影佐立刻派出电报侦察车。
苏三省抓获了交通员并拿到密码本，毕忠良建议影佐使用电报侦察车抓捕“熟地黄”。陈深和唐山海商议找替罪羊，两人都想到钱秘书。陈深让老K冒充钱秘书老乡，诱使他购买假情报。钱秘书向李默群汇报，李默群命令陈深和钱秘书抓捕“熟地黄”。苏三省和刘二宝得知消息，苏三省感到疑惑，但还是答应提供人手。毕忠良在电报侦察车中准备抓捕行动，同时陈深和刘兰芝前往梅机关探视他。苏三省和刘二宝向毕忠良汇报情况，毕忠良识破真相，让两人离开。陈深为毕忠良剪发，这是他们到上海后第一次这样做。
陈深告诉毕忠良他也要跟着钱秘书去看情况，希望能找到救出毕忠良的机会。唐山海告诉徐碧城他不愿意分享“归零计划”，这让徐碧城感慨中国人总为难自己人。陈深在途中看到电讯侦缉车，预感到唐山海有危险。唐山海和徐碧城在发报时被电讯侦缉车发现，苏三省带着日本兵包围了他们。两人被逼到弄堂尽头，唐山海杀死两人后拉着徐碧城逃跑，但徐碧城弄丢了项链。陈深及时赶到，杀死日本兵后带着徐碧城逃跑，但陈深受伤。徐碧城坚持留下来面对困境。
苏三省封锁了所有码头并亲自前往火车站围堵徐碧城，陈深带着枪伤和徐碧城赶往火车站，但被迫躲藏。徐碧城向陈深表白并准备独自面对苏三省。陈深藏在通风管里逃脱，而徐碧城被苏三省带回行动处。毕忠良向徐碧城展示证据并怀疑她是“内鬼”，同时唐山海也被叫回行动处。两人默契配合，将聊天中的话题圆得天衣无缝。陈深带着伤敲响了李小男的门，并请皮蛋帮忙制造假象解释行踪和枪伤。
苏三省在秋风渡找到发报机，确定唐山海和徐碧城是“内鬼”，并向毕忠良报告。毕忠良要找到确凿证据，全城搜捕陈深。苏三省和毕忠良推测陈深接应唐山海和徐碧城，并躲到火车站。毕忠良派人到诊所和医院寻找陈深，并安排验伤。毕忠良纠结于陈深可能是内奸，同时希望在他之前找到陈深。陈深被李小男送到医院，然后被刘二宝带回行动处。毕忠良质问陈深，但被陈深反问。
陈深被毕忠良怀疑并审问，但他通过李小男的配合和线人情报成功洗清嫌疑。然而，整个事件更加扑朔迷离，毕忠良内心依然相信陈深。苏三省试图劝说李小男离开陈深，但李小男坚持自己的选择。毕忠良向陈深提出让他帮忙抓住内鬼，陈深表面冷漠。苏三省调查昌隆饭店事件，发现伙计已离开上海，怀疑陈深买通证人。毕忠良和苏三省决定从徐碧城身上找到她是内鬼的证据，准备审问她，徐碧城紧张而努力地保持镇静。
徐碧城在面对毕忠良和阿毛的审问时保持镇静，但在毕忠良直接质疑下感到紧张。陈深通过手语提示徐碧城应对，却被队员窥见。陈深找到该队员，让他误以为自己和徐碧城的手语是毕忠良的主意。陈深和李小男约陶大春见面，成功逃脱钱秘书的追踪。李默群对徐碧城被关押感到震惊，与唐山海一同前往审讯室。苏三省找到徐碧城的项链，毕忠良以此作为徐碧城是卧底的证据。徐碧城否认，李默群要求她拿出自己的项链证明清白。在陈深的暗示下，徐碧城声称将项链借给了李小男，苏三省要求李小男对质。
李小男在毕忠良的审讯下，与徐碧城默契地回答关于项链的问题，让毕忠良和苏三省失望。李默群听到对话后，指责毕忠良并安慰徐碧城。毕忠良解释自己的“苦肉计”并受到电讯侦缉车截获电报的打击。陈深安排陶大春发电报并藏起钱秘书，制造钱秘书是“熟地黄”的假象。钱秘书被押回审讯室，说出见到陶大春的事情，让李默群命令彻查。陈深被叫到审讯室，钱秘书咬向陈深但没有证据。苏三省带回从钱秘书家搜到的“归零计划”，真相大白，钱秘书是“熟地黄”，将等待梅机关发落。
毕忠良感到压力重重，不知道前路还有多少危机。徐碧城和唐山海回到家，徐碧城因陈深订婚的消息而闷闷不乐。陈深和李小男也回到家，享受片刻宁静。李小男问陈深身份，陈深避而不答。陈深要李小男离开，但李小男不愿离开陈深。陈深找毕忠良和刘兰芝表示不愿订婚，李小男也顺从。曾树感觉钱秘书不是真正的“熟地黄”，向苏三省汇报昌隆饭店伙计和老板一家消失的事情，苏三省决定继续追查。苏三省鼓起勇气给李小男手镯，表示不会放弃她。陈深回避徐碧城，但两人仍相爱。陈深得知曾树要去火车站围堵陶大春，找唐山海和徐碧城商议，唐山海将在行动处值班，陈深部署计划。
陈深救下被曾树围堵的陶大春，并安排他与唐山海联系。李小男受伤被陈深带到徐碧城家，徐碧城内疚并劝陈深娶李小男。陈深带心事到孤儿院吹口琴，徐碧城和唐山海商量送贺礼给李小男。徐碧城给李小男换药，陈深难过。陈深找唐山海倾诉，唐鼓励他保护所爱的人。陈深带徐碧城到孤儿院教堂吹口琴，求她不再劝自己娶李小男，要一起等到革命胜利。苏三省被调新机构，唐山海决定除掉他和曾树。毕忠良高兴上海军统会报复苏三省。苏三省在秋风渡找到发报机，确定唐山海和徐碧城是“内鬼”，并向毕忠良报告。毕忠良要找到确凿证据，全城搜捕陈深。苏三省和毕忠良推测陈深接应唐山海和徐碧城，并躲到火车站。毕忠良派人到诊所和医院寻找陈深，并安排验伤。毕忠良纠结于陈深可能是内奸，同时希望在他之前找到陈深。陈深被李小男送到医院，然后被刘二宝带回行动处。毕忠良质问陈深，但被陈深反问。
陶大春威胁曾树进行交易，唐山海得知苏三省行踪后部署行动。曾树决定联手唐山海对付苏三省，但陶大春误杀曾树，让苏三省逃脱。唐山海接走曾树儿子以防苏三省报复，但苏三省仍派阿强杀害曾树儿子。毕忠良对苏三省的狠毒感到不安。苏三省约见线人，得知陶大春是刺杀他的凶手，同时线人提醒他见好就收。苏三省向影佐将军自荐，领取任务证明实力。他掌握陶大春接头地点，计划秘密行动抓捕“熟地黄”。唐山海给徐碧城买早餐，两人默契讲话，却透露出生离死别意味。唐山海交换情报时被苏三省和影佐监视，影佐让苏三省放假情报引军统人员上钩。
唐山海成功接头交通员后，被苏三省和一名日本军官追赶并调包情报。苏三省将假情报交给影佐，并获得执行打击军统的重要行动权限。唐山海按时返回行动处并告知徐碧城安全，同时给她留下木梳作为礼物。徐碧城接到陈深电话后匆忙逃离家，伪装自己从窗台跳下。苏三省以诱敌之计捉拿唐山海，唐山海被捕并被关入日本牢房。毕忠良因苏三省捉拿“熟地黄”而受挫，对苏三省充满敌意。李小男为离开行动处喝下浓茶引发胃炎，被苏三省送往医院。陈深感到迷茫，担忧唐山海的被捕会暴露自己身份，徐碧城能否逃脱，以及李小男能否传递情报。毕忠良怀疑陈深的小动作，但不想拆穿他，因为苏三省成功将使他被弃用。
苏三省在大雨中行动，但大方旅社失火导致行动失败。毕忠良质问陈深为何隐瞒唐山海和徐碧城的问题，但陈深反驳他的忠诚于日本人的立场。李小男醒来后请求与陈深见面，苏三省同意。陈深看望李小男并欠下人情，但他不希望小男卷入不幸。徐碧城晕倒后与陈深见面，她坚持留下来陪两人度过难关。唐山海在监牢中守口如瓶，担忧徐碧城但得知她逃脱后如释重负。李默群为外甥女和外甥女婿求情，但影佐不听。
李默群从影佐将军处得知苏三省抓了其亲眷唐山海，愤怒地打了苏三省。苏三省误信徐碧城是“熟地黄”的谣言，引发了一系列麻烦。李默群决定让毕忠良审讯唐山海。陈深暗中帮助唐山海和徐碧城，苏三省无法查出真相。在押解途中，陈深向唐山海说明形势，毕忠良决定与陈深联手帮助他们。徐碧城思念唐山海，陈深告诉她已将唐山海带回行动处，但两人仍担忧任务。
徐碧城急于找到陶大春除掉苏三省，但陈深认为她是营救唐山海的关键，应坚守身份。陈深探望李小男，提议她离开上海，但她拒绝了。在狱中，唐山海提出以一艘通往重庆的船换取自由，毕忠良同意并计划策反他。陈深告诉徐碧城自己的身世和计划，两人感情加深。陶大春追踪陈深，陈深承诺会帮助唐山海，陶大春半信半疑。毕忠良接到军统电话，戴笠欢迎他合作，并寄来情报让唐山海立功。陈深从信箱取出情报，并告诉徐碧城。徐碧城为皮皮做衣服时感到不安，匆忙出门。苏三省在秋风渡找到发报机，确定唐山海和徐碧城是“内鬼”，并向毕忠良报告。毕忠良要找到确凿证据，全城搜捕陈深。苏三省和毕忠良推测陈深接应唐山海和徐碧城，并躲到火车站。毕忠良派人到诊所和医院寻找陈深，并安排验伤。毕忠良纠结于陈深可能是内奸，同时希望在他之前找到陈深。陈深被李小男送到医院，然后被刘二宝带回行动处。毕忠良质问陈深，但被陈深反问。
扁头要与朱珠结婚，陈深慷慨借给扁头一百块钱，扁头感激不已，决心跟随陈深。陈深关心下属，与苏三省形成鲜明对比。李默群在狱中责骂唐山海，但毕忠良为他求情。唐山海请求参加行动，戴罪立功。徐碧城和陶大春会面，得知重庆用两条共党性命换唐山海的命，她怒斥陶大春隐瞒陈深。毕忠良策反唐山海成功，准备抓捕军统。苏三省得知此事后感到不安。徐碧城赶往红磨坊，想救出无辜的人，却被毕忠良发现。唐山海走进咖啡店，陈深在外巡逻，毕忠良暗中观察。徐碧城扮成服务员告诉唐山海真相，但他想保护徐碧城和陈深。陈深意识到接头人可能是共党，传讯让他们离开。此时，李小男和朱珠也在红磨坊，局面混乱。陶大春来营救唐山海，混乱中陈深和刘二宝受伤，李小男晕倒。苏三省冲向李小男，狙击手向唐山海开枪，徐碧城带他逃跑。
陈深拦截了逃跑的徐碧城和唐山海，唐山海解释是陶大春的谎言导致混乱。陈深无奈让唐山海劫持自己，掩护徐碧城逃跑。唐山海感激陈深，送她玫瑰花。唐山海被毕忠良击中，陈深晕倒。徐碧城目睹一切，痛苦不已。陈深住院，与毕忠良讨论可疑迹象，怀疑女服务员。毕忠良对唐山海不满，唐山海感到安宁，认为自己值得。刘兰芝探望陈深，表示永远支持他。苏三省监视李小男，她趁机溜走找徐碧城。徐碧城内疚，李小男安慰她。李默群要求处决唐山海，由苏三省执行。毕忠良宣扬苏三省，实则想借重庆军统之手除掉他。小男透露徐碧城情况不佳，陈深沉重地为唐山海剃头。
苏三省得到新房子，与姐姐分享喜悦，并邀请李小男来家吃饭。唐山海将被执行死刑，徐碧城和陈深沉浸在悲伤中。唐山海要陈深转告对徐碧城的爱，徐碧城大哭。唐山海坦然面对死亡，苏三省气急败坏，但最终唐山海被掩埋。徐碧城和陈深为唐山海上香，她想要报仇，但陈深认为应该为了光明前行。苏三省带李小男回家做客，似乎没有受到杀人影响。
李小男给苏姐红包和手镯作为乔迁之喜的礼物，但坚决要还回手镯，断了和苏三省的关系。她认为苏三省可怕，希望他能为了自己收手。苏三省坚持自己的价值观，认为追求名利才能给心爱的人幸福。徐碧城制作炸药想要杀死苏三省为唐山海报仇，但被陈深劝阻。苏姐得知苏三省是汉奸，苏三省谎称自己是卧底来安抚她。李小男知道皮皮是陈深的亲人。徐碧城单独行动扔炸药时被苏三省发现，幸得陶大春相救。毕忠良想利用苏三省，故意透露情报给他。扁头发现苏姐变卖首饰，怀疑与蹊跷的笔友有关，报告给陈深。
麻雀在一年内搜集了18份情报，让毕忠良深感困扰。他不再希望查出内奸，而是反思自己的失职。陈深告诉毕忠良苏姐变卖首饰的事，导致苏三省对姐姐发火。苏姐希望苏三省离开，但苏三省仍喜欢追逐名利。徐碧城为报仇要陶大春跟踪李小男找苏三省，但苏三省抓到共党杜欢乐并残忍拷打。毕忠良得知陈深也收买阿强，要求情报只卖给他。一年后，李小男准备晚餐等陈深，却等来苏三省表白被拒。苏三省与她打赌，陈深不会挽留她。苏三省转恨陈深，而陈深与徐碧城漫步。李小男向陈深表白，知道自己无法替代徐碧城，决定放手。她仍想知道自己在陈深心中的位置。苏三省在秋风渡找到发报机，确定唐山海和徐碧城是“内鬼”，并向毕忠良报告。毕忠良要找到确凿证据，全城搜捕陈深。苏三省和毕忠良推测陈深接应唐山海和徐碧城，并躲到火车站。毕忠良派人到诊所和医院寻找陈深，并安排验伤。毕忠良纠结于陈深可能是内奸，同时希望在他之前找到陈深。陈深被李小男送到医院，然后被刘二宝带回行动处。毕忠良质问陈深，但被陈深反问。
陈深告诉李小男，她在他心中是最亲的人。扁头找阿强打听情报，阿强在毕忠良重金诱惑下撒谎称杜欢乐未被抓。苏三省得知杜欢乐是中共交通员后大惊，继续拷问。得知“医生”接头信息，苏三省准备行动，阿强告知刘二宝。毕忠良欲先抓“大鱼”，命陈深行动。陈深知“医生”是李小男，感绝望。毕忠良启动狙击手“瘸子”狙击苏三省。陈深先至旧仓库，为李小男戴上手铐，发现她吞下情报。苏三省震惊李小男是“医生”。毕忠良觉她与“宰相”相像。陈深悔恨未早送李小男离沪，急令海燕离沪去杭。
海燕离沪。毕忠良责备陈深被李小男欺骗。陈深提醒毕忠良调查李小男胃疼被送医的真相。影佐怒知李小男是“医生”，怀疑陈深、毕忠良太太、苏三省与她同谋。李默群建议先审李小男。影佐请李小男吃饭，她展现胆识，交代打入行动处的计划，指责陈深被利用，揭露李默群、毕忠良、苏三省的罪行。陈深知李小男混淆视听保护他。影佐软禁三人，陈深派扁头找徐碧城求助。影佐预测“麻雀”会派人行动，令李默群盯紧接触者。刘二宝发现李小男与护士朱海燕接触，海燕已离沪。毕忠良感事态复杂。
扁头心不在焉，告诉陈深李小男之事，朱珠劝他帮忙。毕忠良与李默群彻查，不让告诉毕太太。苏三省怀疑阿强泄露消息，警告后作罢。扁头让朱珠送情报给徐碧城，自己被人盯上。朱珠在青峰茶馆告诉徐碧城李小男是中共且被抓。陈深给扁头两把钥匙，分别放李小男家和苏三省家。徐碧城藏钥匙于苏三省家，借小朋友传话引苏姐去电影公司。苏姐担忧李小男和苏三省，徐碧城冒充苏三省朋友带走她。毕忠良拿到李小男家钥匙，计划守株待兔。李默群问毕忠良如何从陈深和苏三省找突破点，毕忠良表示需要时间和空间。
陈深与李小男在监听下演戏，陈深用摩斯密码告诉小男有窃听器，并计划嫁祸苏三省。小男未背叛信仰。毕忠良和李默群未从陈深话中发现纰漏，决定让苏三省审问小男。苏三省眼神冷酷审讯小男，小男故意透露有重要资料在交通银行保险柜，钥匙在苏家。苏三省回家发现姐姐和金条不见，姐姐实被徐碧城带走。徐碧城找陶大春帮忙救小男。苏三省在不知情下用陈深名字去开保险柜。
苏三省被抓住并带回行动处，柜子里发现的是金条。李默群和毕忠良审问苏三省，苏三省坚称被陷害，但证据确凿。毕忠良开始严刑审问李小男，陈深担心她受不了。李小男用摩斯密码告知陈深上线刘医生的电话，陈深联系上并传递了被捕消息。毕忠良给陈深看了从李小男、苏三省家搜来的物品，陈深用火烤显出了字迹，证据确凿。毕忠良对陈深存有私心，动了录音手脚，李默群相信苏三省是麻雀。苏三省大骂毕忠良。苏三省在秋风渡找到发报机，确定唐山海和徐碧城是“内鬼”，并向毕忠良报告。毕忠良要找到确凿证据，全城搜捕陈深。苏三省和毕忠良推测陈深接应唐山海和徐碧城，并躲到火车站。毕忠良派人到诊所和医院寻找陈深，并安排验伤。毕忠良纠结于陈深可能是内奸，同时希望在他之前找到陈深。陈深被李小男送到医院，然后被刘二宝带回行动处。毕忠良质问陈深，但被陈深反问。
苏三省被指控为“麻雀”，他坚信是毕忠良陷害自己，要求见影佐将军。李默群向影佐报告证据，但影佐怀疑这是毕忠良对苏三省的陷害。影佐认为李小男想让苏三省死以掩护“麻雀”，而“麻雀”仍在毕忠良和陈深中。李默群继续调查。陈深忍不住去看李小男，两人隔着栏杆交流。陈深告诉小男毕忠良和李默群暂信苏三省是“麻雀”，已送出情报。毕忠良知道后大怒，派人盯住陈深。陈深逃脱监视去找徐碧城，他担心徐碧城的安全。李默群打电话给毕忠良说苏三省不是“麻雀”，让毕忠良不安。李默群和毕忠良释放苏三省，并宣布苏三省将执行李小男的死刑，告诫三人好自为之。苏三省陷害事件告一段落，但毕忠良与苏三省的较量加剧。
陈深给李小男戴上戒指，表白后离开。苏三省来到牢房，看到李小男穿着陈深的衬衣，更加狂躁，用衬衣勒住她的脖子并吻她。扁头看到后愤怒地威胁苏三省，最终苏三省离开。徐碧城询问陈深是否有办法救李小男，陈深只能送她去刑场。徐碧城告诉苏姐苏三省是卧底，但被苏姐误会。陶大春计划用苏姐的命换李小男的命，徐碧城反对但无效。李默群约见毕忠良，提出苏三省可能和李小男勾结，要毕忠良暗中跟随陈深和苏三省。毕忠良因太太受伤去医院，让陈深全权负责行刑。陈深陪李小男吃最后一顿饭，心情沉重。毕忠良怀疑向刘兰芝滋辣椒水的孩子受人指使，觉得此事不简单。
徐碧城得知毕忠良紧随陈深后，匆忙赶往苏姐住处阻止陶大春的计划。苏姐偷听到他们的对话，得知苏三省是汉奸，心如死灰。她跑到刑场想救出李小男，但被毕忠良狙击手杀害。苏三省精神崩溃，开枪打死了李小男。陈深悲痛欲绝，让扁头取回仙人头。毕忠良怀疑其中有秘密，但什么都没发现。苏三省发誓要为姐姐报仇。
李默群质问苏三省关于他姐姐的事情，苏三省怀疑是军统和共党联手杀害了她。毕忠良则装作不知情，希望苏三省与军统结仇。陈深很久没去孤儿院看皮皮，这天他收到小男留给他的信，得知“宰相”是她的亲姐姐，为了革命她让陈深放弃营救。小男告诉陈深，她的信仰和他就是她最重要的东西。陈深和徐碧城决定忘记苦难，一起去延安革命。毕忠良怀疑陈深是伪装者，利用了他。朱珠和扁头为李小男烧纸，毕忠良和太太谈论李小男，无意中提到陈深常去看望孤儿院的皮皮。毕忠良怀疑皮皮与共党有关，苏三省也派人偷走了皮皮。陈深和毕太太得知皮皮失踪后，怀疑与“回家计划”有关，陈深决定找到皮皮。
毕忠良向陈深展示“回家计划”，暗示皮皮与此有关。陈深怀疑这是圈套，但决定审问庞勇以救皮皮。庞勇自尽，陈深怀疑其身份和毕忠良的动机。陈深得到皮皮线索，却不知这是苏三省的陷阱。苏三省请求狙击手对付陈深同伴，同时猜测毕忠良派出的狙击手是伤害自己和姐姐的人。陈深送馄饨给毕忠良，然后孤身救皮皮。毕太太意外出现并谎称自己是共党，徐碧城救了她。毕忠良怒斥苏三省，苏三省却留下窃听录音。毕忠良下令抓捕苏三省，陈深明白这是圈套，再次使用反间计指责毕忠良。苏三省在秋风渡找到发报机，确定唐山海和徐碧城是“内鬼”，并向毕忠良报告。毕忠良要找到确凿证据，全城搜捕陈深。苏三省和毕忠良推测陈深接应唐山海和徐碧城，并躲到火车站。毕忠良派人到诊所和医院寻找陈深，并安排验伤。毕忠良纠结于陈深可能是内奸，同时希望在他之前找到陈深。陈深被李小男送到医院，然后被刘二宝带回行动处。毕忠良质问陈深，但被陈深反问。
苏三省受伤后逃到农家，发誓要报复毕忠良和陈深。李默群支持毕忠良抓捕苏三省。苏三省杀死程青山妻子，胁迫他为自己所用。陈深听到枪响赶过去，但苏三省逃跑了。陈深觉得自己可能暴露，决定与苏三省斗争到底。苏三省带程青山回上海，被毕忠良抓捕。苏三省试图指证陈深是中共，但毕忠良不置可否。程青山感激陈深，不会指证他。苏三省赌上性命还是输了，被阿四咬死。陈深和徐碧城为唐山海和李小男报仇，但陈深还需完成“归零计划”的任务。他利用与毕忠良的兄弟情义，进入毕忠良办公室寻找计划，但被毕忠良发现。毕忠良和刘兰芝到孤儿院打算领养孩子，并在刘兰芝生日宴上，陈深意识到“归零计划”就藏在妞妞的照片里。
陈深在毕忠良家中找到“归零计划”，但被毕忠良发现。两人拔枪相向，刘兰芝闯入，陈深未开枪，毕忠良替妻子挡住狙击手“瘸子”的子弹，重伤。陈深将“归零计划”交给汪姐后，引爆炸弹制造逃跑假象。徐碧城被陶大春所救，但精神崩溃。陈深后来到延安与众人相会，原来他并未死亡。刘兰芝成为孤儿院嬷嬷，远离战火。1946年的上海，国共之战在即，陈深和徐碧城分别在各自的组织中继续战斗。
